108 年底，大陸地區武漢傳出嚴重特殊傳染性肺炎 (COVID-19，簡稱武漢肺炎 )，臺灣與大陸僅海峽之隔，無論是地理位置或人口流動，臺灣與大陸的密切度均為世界第一，但臺灣疫情並未大規模擴散，歸功於防疫團隊在知悉武漢肺炎發生之初，即正視疫情的嚴重性，並在第一時間提出應變措施，設置中央流行疫情指揮中心，進行境管措施、注檢追蹤、通報等等作為。本署在防疫團隊中扮演重要角色，相關幹部和同仁每天都接受超高強度的挑戰，防疫任務繁重，所有的努力只為在防疫前線為國人守護國門。