本署與日本法務省入國管理局自95年起,以隔年異地方式輪流舉辦「臺日入出國管理會議」。除透過會議進行移民事務交流外,日本法務省入國管理局每年均派員參加我國防制人口販運國際工作坊,並派遣專業移民官員出席國境管理會議,分享移民事務與防制人口販運等工作經驗